論文
山本 詠士
41~60件（全75件）
Detection of transition times from single-particle-tracking trajectories
- 著者名
- T Akimoto, E Yamamoto
- 掲載誌名
- 誌名Physical Review E 96 (5), 052138 巻96(号5) (出版年（月日）2017年）
- ISSN
- 2470-0045
Separation of water-ethanol solutions with carbon nanotubes and electric fields
- 著者名
- Winarto, Takaiwa Daisuke, Yamamoto Eiji, Yasuoka Kenji
- 掲載誌名
- 誌名PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 巻18(号48) 開始ページ33310 - 終了ページ33319 (出版年（月日）2016年）
- ISSN
- 1463-9076
Effects of temperature, concentration, and isomer on the hydration structure in monosaccharide solutions
- 著者名
- K Tomobe, E Yamamoto, M Yasui, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名Physical Chemistry Chemical Physics 19 (23), 15239-15246 巻19(号23) 開始ページ15239 - 終了ページ15246 (出版年（月日）2017年）
- ISSN
- 1463-9076
The Acidic Tail of HMGB1 Regulates its Secondary Structure and Conformational Flexibility: A Circular Dichroism and Molecular Dynamics Simulation Study
- 著者名
- WL Anggayasti, K Ogino, E Yamamoto, E Helmerhorst, K Yasuoka, ...
- 掲載誌名
- 誌名Computational and Structural Biotechnology Journal 開始ページ1160 - 終了ページ1172 (出版年（月日）2020年）
- ISSN
- 2001-0370
Universal relation between instantaneous diffusivity and radius of gyration of proteins in aqueous solution
- 著者名
- E Yamamoto, T Akimoto, A Mitsutake, R Metzler
- 掲載誌名
- 誌名arXiv preprint arXiv:2009.06829 巻126(号12) (出版年（月日）2020年）
- ISSN
- 0031-9007
Molecular Dynamic Simulations to Probe Water Permeation Pathways of GPCRs
- 著者名
- K Tomobe, E Yamamoto, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名G Protein-Coupled Receptor Signaling, 21-30 開始ページ21 - 終了ページ30 (出版年（月日）2019年）
- ISSN
- 1064-3745
Separation of water-alcohol mixtures using carbon nanotubes under an electric field
- 著者名
- Winarto, Yamamoto Eiji, Yasuoka Kenji
- 掲載誌名
- 誌名PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 巻21(号28) 開始ページ15431 - 終了ページ15438 (出版年（月日）2019年07月）
- ISSN
- 1463-9076
Differences in ligand-induced protein dynamics extracted from an unsupervised deep learning approach correlate with protein–ligand binding affinities
- 著者名
- I Yasuda, K Endo, E Yamamoto, Y Hirano, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名Communications Biology 5 (1), 1-9 (出版年（月日）2022年）
Theoretical Design of a Janus-Nanoparticle-Based Sandwich Assay for Nucleic Acids
- 著者名
- T Sato, K Esashika, E Yamamoto, T Saiki, N Arai
- 掲載誌名
- 誌名International Journal of Molecular Sciences 23 (15), 8807 巻23(号15) (出版年（月日）2022年）
- ISSN
- 1661-6596
Water structures in tip-charged carbon nanotubes
- 著者名
- Y Ono, E Yamamoto, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名The Journal of Chemical Physics 161 (5) 巻161(号5) (出版年（月日）2024年）
- ISSN
- 0021-9606
Molecular dynamics study on the permeation directionality of water molecules through AQP4
- 著者名
- N Kuribayashi, E Yamamoto, Y Hirano, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名Biophysical Journal 123 (3), 66a-67a 巻123(号3) 開始ページ66A - 終了ページ67A (出版年（月日）2024年）
- ISSN
- 0006-3495
Large‐Scale FMO‐MP2 Calculations of the Spike Protein Droplet Model
- 著者名
- H Doi, T Nakano, K Sakakura, K Akisawa, K Okuwaki, Y Hirano, ...
- 掲載誌名
- 誌名Journal of Computational Chemistry 46 (4), e70052 (出版年（月日）2025年）
Highly bright and stable NIR-BRET with blue-shifted coelenterazine derivatives for deep-tissue imaging of molecular events in vivo
- 著者名
- R Nishihara, R Paulmurugan, T Nakajima, E Yamamoto, A Natarajan, ...
- 掲載誌名
- 誌名Theranostics 9 (9), 2646 巻9(号9) 開始ページ2646 - 終了ページ2661 (出版年（月日）2019年）
- ISSN
- 1838-7640
FMO-based interaction analysis on DEET/icaridin—AgamOBP1 complex
- 著者名
- K Akisawa, Y Sakuma, A Tsukamoto, H Doi, K Okuwaki, Y Hirano, ...
- 掲載誌名
- 誌名Chemistry Letters 54 (2), upaf030 (出版年（月日）2025年）
Coarse-grained model of disordered RNA for simulations of biomolecular condensates
- 著者名
- I Yasuda, S von Bülow, G Tesei, E Yamamoto, K Yasuoka, ...
- 掲載誌名
- 誌名Journal of chemical theory and computation 21 (5), 2766-2779 巻21(号5) 開始ページ2766 - 終了ページ2779 (出版年（月日）2025年）
- ISSN
- 1549-9618
Estimating relaxation times from a single trajectory
- 著者名
- T Akimoto, E Yamamoto, T Uneyama
- 掲載誌名
- 誌名Journal of the Physical Society of Japan 92 (7), 074005 巻92(号7) (出版年（月日）2023年）
- ISSN
- 0031-9015
Tunable pheromone interactions among microswimmers
- 著者名
- B Nakayama, H Nagase, H Takahashi, Y Saito, S Hatayama, K Makino, ...
- 掲載誌名
- 誌名Proceedings of the National Academy of Sciences 120 (9), e2213713120 巻120(号9) (出版年（月日）2023年）
- ISSN
- 0027-8424
Heterogeneous biological membranes regulate protein partitioning via fluctuating diffusivity
- 著者名
- K Sakamoto, T Akimoto, M Muramatsu, MSP Sansom, R Metzler, ...
- 掲載誌名
- 誌名PNAS nexus 2 (8), pgad258 巻2(号8) (出版年（月日）2023年）
Ligand-induced protein dynamics differences correlate with protein-ligand binding affinities: An unsupervised deep learning approach
- 著者名
- I Yasuda, K Endo, E Yamamoto, Y Hirano, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名arXiv preprint arXiv:2109.01339 (出版年（月日）2021年）
Structures of water molecules in carbon nanotubes induced with electric fields and its application for water-methanol separation
- 著者名
- W Winarto, D Takaiwa, E Yamamoto, K Yasuoka
- 掲載誌名
- 誌名Applied Mechanics and Materials 842, 453-456 (出版年（月日）2016年）